30.03.2020
Potential Rapid Diagnostics, Vaccine and Therapeutics for 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV): A Systematic Review
Diagnostique Transversale
Pang J et al
J Clin Med
Résultats principaux
Résultats répartis en trois domaines : diagnostic, vaccins et thérapie pour les maladies SRAS, MERS et SRAS-CoV-2
Diagnostic
SRAS-Cov-2
- sur les 16 études sélectionnées, 1 a proposé la RT-PCR comme méthode de diagnostic
- il a été démontré que dans les premiers stades de la maladie, le prélèvement naso-pharyngé était positif alors que le sérum était négatif
- 7 kits possibles pour le diagnostic rapide mais un seul approuvé pour la pratique clinique, celui de Beijing Génome Institut
MERS-CoV
- 4 études ont proposé comme techniques de diagnostic: RT-LAMP (reverse transcription loop-mediated isothermal amplification), RT-iiPCR (RT-insulated isothermal PCR), one step rRT-PCR.
RT-LAMP a une sensibilité similaire à celle de la real time RT-PCR, une grande spécificité, elle est rapide et économique. RT-PCR et one step rRT-PCR ont sensibilité et spécificité similaires
- une étude portant sur 6 kits de RT-PCR en temps réel, tous à haute sensibilité
SRAS-CoV
- 11 études sur différentes techniques : la comparaison entre les tests moléculaires (ex. RT-PCR) et les tests sérologiques (ex. ELISA) a montré que les tests moléculaires sont plus sensibles et plus spécifiques
Vaccins
- sur un total de 570 études, seules 4 ont été retenues par les revues
- les quatre études étaient des essais cliniques de phase I sur des vaccins proposés pour le SRAS et le MERS (aucun essai trouvé pour le SRAS-CoV-2): tous les vaccins proposés étaient sûrs, bien tolérés et ont développé une réponse immunitaire adéquate chez les participants
Thérapie
SRAS-CoV-2
- au moment de l'examen, aucune étude n'a encore publié les résultats
- sur 23 trials, les 9 essais cliniques trouvés sur ClinicalTrials.gov : 5 études portaient sur l'hydroxychloroquine, le lopinavir+ ritonavir + arbidol, les cellules souches mésenchymateuses, la médecine traditionnelle chinoise et les glucocorticoïdes (recrutement commencé), 4 études portaient sur antiviraux, interferon, darunavir et cobicistat, arbidol et semdesivir
SRAS
- essais contrôlés randomisés pendant l'épidémie de SRAS :
* un essai a examiné l'utilisation d'antibiotiques sur 190 patients,
* un essai comparait la médecine chinoise et occidentale à la médecine traditionnelle chinoise (n=132)
* un essai a examiné l'intégration entre la médecine chinoise et la médecine occidentale (n=49)
* un essai a examiné l'utilisation de la médecine chinoise spécifique (n=4)
* un essai a examiné l'utilisation précoce de corticostéroïdes (n=16)
- étude non randomisée qui a analysé l'utilisation de ribavirin, lopinavir, ritonavir sur 152 pts
MERS
- étude randomisée qui a analysé l'utilisation de lopinavir, ritonavir e interféron bêta 1B
- une étude clinique de phase I évaluant la sécurité et la tolérabilité des immunoglobulines IgG polyclonales
Diagnostic
SRAS-Cov-2
- sur les 16 études sélectionnées, 1 a proposé la RT-PCR comme méthode de diagnostic
- il a été démontré que dans les premiers stades de la maladie, le prélèvement naso-pharyngé était positif alors que le sérum était négatif
- 7 kits possibles pour le diagnostic rapide mais un seul approuvé pour la pratique clinique, celui de Beijing Génome Institut
MERS-CoV
- 4 études ont proposé comme techniques de diagnostic: RT-LAMP (reverse transcription loop-mediated isothermal amplification), RT-iiPCR (RT-insulated isothermal PCR), one step rRT-PCR.
RT-LAMP a une sensibilité similaire à celle de la real time RT-PCR, une grande spécificité, elle est rapide et économique. RT-PCR et one step rRT-PCR ont sensibilité et spécificité similaires
- une étude portant sur 6 kits de RT-PCR en temps réel, tous à haute sensibilité
SRAS-CoV
- 11 études sur différentes techniques : la comparaison entre les tests moléculaires (ex. RT-PCR) et les tests sérologiques (ex. ELISA) a montré que les tests moléculaires sont plus sensibles et plus spécifiques
Vaccins
- sur un total de 570 études, seules 4 ont été retenues par les revues
- les quatre études étaient des essais cliniques de phase I sur des vaccins proposés pour le SRAS et le MERS (aucun essai trouvé pour le SRAS-CoV-2): tous les vaccins proposés étaient sûrs, bien tolérés et ont développé une réponse immunitaire adéquate chez les participants
Thérapie
SRAS-CoV-2
- au moment de l'examen, aucune étude n'a encore publié les résultats
- sur 23 trials, les 9 essais cliniques trouvés sur ClinicalTrials.gov : 5 études portaient sur l'hydroxychloroquine, le lopinavir+ ritonavir + arbidol, les cellules souches mésenchymateuses, la médecine traditionnelle chinoise et les glucocorticoïdes (recrutement commencé), 4 études portaient sur antiviraux, interferon, darunavir et cobicistat, arbidol et semdesivir
SRAS
- essais contrôlés randomisés pendant l'épidémie de SRAS :
* un essai a examiné l'utilisation d'antibiotiques sur 190 patients,
* un essai comparait la médecine chinoise et occidentale à la médecine traditionnelle chinoise (n=132)
* un essai a examiné l'intégration entre la médecine chinoise et la médecine occidentale (n=49)
* un essai a examiné l'utilisation de la médecine chinoise spécifique (n=4)
* un essai a examiné l'utilisation précoce de corticostéroïdes (n=16)
- étude non randomisée qui a analysé l'utilisation de ribavirin, lopinavir, ritonavir sur 152 pts
MERS
- étude randomisée qui a analysé l'utilisation de lopinavir, ritonavir e interféron bêta 1B
- une étude clinique de phase I évaluant la sécurité et la tolérabilité des immunoglobulines IgG polyclonales
Que retenir ?
Diagnostic
1)le diagnostic de laboratoire peut être effectué à l'aide de 4 techniques :
*recherche du matériel génétique du virus (limites : possibilité de réaction croisée avec des régions génétiques non spécifiques et intervalle de temps limité au début de l'infection)
*recherche d'anticorps spécifiques,
*tests sérologiques (limites : deux échantillons doivent être prélevés dans la phase aiguë et pendant la rémission des symptômes pour exclure toute réaction croisée),
*culture et isolement de particules virales (limites : longue durée de vie et compétences techniques élevées)
2) Pour le SRAS et le MERS, les échantillons provenant de voies respiratoires basses présentaient des taux d'ARN viral plus élevés et plus prolongés que les échantillons de voies respiratoires hautes
Vaccins
1) il n'existe actuellement aucun vaccin en cours de développement ou testé pour SRAS-CoV-2
Thérapie
1) Plusieurs essais cliniques ont débuté en Chine sur la base des thérapies proposées pour les SRAS et les MERS:
- Interféron : l'interféron bêta semble plus actif que l'interféron alpha. L'utilisation d'interféron + corticostéroïdes semble améliorer l'oxygénation et réduire les anomalies de la radiographie thoracique. Le timing de la thérapie semble avoir une grande importance sur l'efficacité.
- Ribavirin: médicament le plus utilisé selon la littérature, utilisé à des doses thérapeutiques ou en prophylaxie chez les professionnels de santé exposés
- Lopinavir/ritonavir: première combinaison proposée d'inhibiteurs de protéase, efficacité signalée dans de nombreuses études, peu d'effets secondaires (moins que ribavirin seul)
- Plasma des convalescents à différentes doses : les études font état d'une réduction significative de la mortalité par rapport au placebo mais les études ont un faible niveau de preuve car elles portent sur de petits échantillons
- Chloroquine : réduit la production et la libération de facteurs qui médient l'inflammation et agit sur le récepteur ACE2 et le pH endosomal
- Niclosamide: inhibe la synthèse virale
- Glycyrrhizine: inhibe la pénétration pendant les premiers stades de la réplication virale
1)le diagnostic de laboratoire peut être effectué à l'aide de 4 techniques :
*recherche du matériel génétique du virus (limites : possibilité de réaction croisée avec des régions génétiques non spécifiques et intervalle de temps limité au début de l'infection)
*recherche d'anticorps spécifiques,
*tests sérologiques (limites : deux échantillons doivent être prélevés dans la phase aiguë et pendant la rémission des symptômes pour exclure toute réaction croisée),
*culture et isolement de particules virales (limites : longue durée de vie et compétences techniques élevées)
2) Pour le SRAS et le MERS, les échantillons provenant de voies respiratoires basses présentaient des taux d'ARN viral plus élevés et plus prolongés que les échantillons de voies respiratoires hautes
Vaccins
1) il n'existe actuellement aucun vaccin en cours de développement ou testé pour SRAS-CoV-2
Thérapie
1) Plusieurs essais cliniques ont débuté en Chine sur la base des thérapies proposées pour les SRAS et les MERS:
- Interféron : l'interféron bêta semble plus actif que l'interféron alpha. L'utilisation d'interféron + corticostéroïdes semble améliorer l'oxygénation et réduire les anomalies de la radiographie thoracique. Le timing de la thérapie semble avoir une grande importance sur l'efficacité.
- Ribavirin: médicament le plus utilisé selon la littérature, utilisé à des doses thérapeutiques ou en prophylaxie chez les professionnels de santé exposés
- Lopinavir/ritonavir: première combinaison proposée d'inhibiteurs de protéase, efficacité signalée dans de nombreuses études, peu d'effets secondaires (moins que ribavirin seul)
- Plasma des convalescents à différentes doses : les études font état d'une réduction significative de la mortalité par rapport au placebo mais les études ont un faible niveau de preuve car elles portent sur de petits échantillons
- Chloroquine : réduit la production et la libération de facteurs qui médient l'inflammation et agit sur le récepteur ACE2 et le pH endosomal
- Niclosamide: inhibe la synthèse virale
- Glycyrrhizine: inhibe la pénétration pendant les premiers stades de la réplication virale
Niveau de preuve Faible
1) revue systématique de 27 études (publiés en PubMed, Embase et Cochrane library) et 19 études (Google)
2) publication bias: certains progrès peuvent avoir été publiés et d'autres peuvent encore être des données confidentielles
3) reporting bias: peut être due à la nécessité de publier rapidement les résultats
4) pas de méta-analyse des données: en raison du nombre limité de données fournies et de la manière hétérogène de présenter les résultats dans les différentes études
Objectifs
Revue systématique des formes possibles de diagnostic rapide, de vaccins et de thérapies pour le SRAS-CoV-2, le MERS-CoV et le SRAS-CoV afin d'orienter les axes de recherche et de développement
Méthodes
Revue systématique:
Recherche systématique sur les bases de données PubMed, Embase et Cochrane Library pour trois maladies (SRAS, MERS et 2019-nCoV) selon les directives de PRISMA-Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses.
Recherche divisée en trois domaines (diagnostic, vaccins et traitement) en utilisant comme mots-clés SARS, coronavirus, MERS, 2019 Novel coronavirus, Wuhan virus.
Critères d'inclusion :
- essais randomisés et contrôlés,
- essais de validation des tests de diagnostic,
- langue anglaise,
- date entre le 1er décembre 2019 et le 6 février 2020 (pour SRAS-CoV-2)
Critères d'exclusion :
- études examinant le mécanisme des tests de diagnostic, des vaccins et des traitements
Sur un total de 1065 études trouvées, 27 répondaient aux critères de l'examen systématique
Stratégies supplémentaires :
1) recherche sur Google et analyse des articles des 5 premières pages (19 articles analysés dans la revue),
2) liste des kits de diagnostic possibles établie par le Dr Kim J.Png,
3) recherche d'essais cliniques sur https://clinicaltrials.gov/
Recherche systématique sur les bases de données PubMed, Embase et Cochrane Library pour trois maladies (SRAS, MERS et 2019-nCoV) selon les directives de PRISMA-Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses.
Recherche divisée en trois domaines (diagnostic, vaccins et traitement) en utilisant comme mots-clés SARS, coronavirus, MERS, 2019 Novel coronavirus, Wuhan virus.
Critères d'inclusion :
- essais randomisés et contrôlés,
- essais de validation des tests de diagnostic,
- langue anglaise,
- date entre le 1er décembre 2019 et le 6 février 2020 (pour SRAS-CoV-2)
Critères d'exclusion :
- études examinant le mécanisme des tests de diagnostic, des vaccins et des traitements
Sur un total de 1065 études trouvées, 27 répondaient aux critères de l'examen systématique
Stratégies supplémentaires :
1) recherche sur Google et analyse des articles des 5 premières pages (19 articles analysés dans la revue),
2) liste des kits de diagnostic possibles établie par le Dr Kim J.Png,
3) recherche d'essais cliniques sur https://clinicaltrials.gov/
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