Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with Respiratory Failure
Résultats principaux
Détection d'associations croisées significatives avec rs11385942 au locus 3p21.31 et avec rs657152 au locus 9q34.2 dans la méta-analyse de deux panels de cas-témoins : OR = 1,77 (95%CI : 1,48-2,11), et OR = 1,32 (95%CI : 1,20-1,47), respectivement.
Au locus 3p21.31, le signal d'association couvrait les gènes SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6 et XCR1.
Au locus 9q34.2, le signal d'association coïncidait avec le locus du groupe sanguin A/B/O ; dans cette cohorte, une analyse spécifique des groupes sanguins a montré un risque plus élevé chez le groupe A qu'avec les autres groupes sanguins (OR = 1,45 [95% CI : 1,20-1,75]), et un effet protecteur pour le groupe O par rapport aux autres groupes sanguins (OR = 0,65 [95% CI : 0,53-0,79]).
Que retenir ?
Cette étude a identifié le groupe génétique 3p21.31 comme un locus de susceptibilité génétique chez les patients atteints de COVID-19 avec une insuffisance respiratoire.
Cette étude a aussi confirmé une association potentielle avec les groupes sanguins ABO.
Niveau de preuve Intermédiaire
- L'étude génétique a été bien faite et a utilisé des techniques de détection fiables
- L'analyse statistique est conforme aux pratiques actuelles en matière d'analyses génétiques, compte tenu de nombreux facteurs de confusion potentiels
- Manque d'informations sur les caractéristiques des patients et absence de corrélations avec les données cliniques, notamment de leur état respiratoire
Objectifs
Méthodes
Étude d'associations pan-génotypiques.
1980 patients avec une manifestation sévère de COVID-19 (définie par une insuffisance respiratoire) dans sept hôpitaux dans les épicentres italiens et espagnols de la pandémie de SARS-CoV-2 en Europe.
Après contrôles de qualité et l'exclusion des valeurs aberrantes de la population, inclusion de 835 patients et 1 255 témoins d'Italie ainsi que de 775 patients et 950 témoins en Espagne.
Au total, 8 582 958 polymorphismes mono-nucléotidiques ont été analysés dans le cadre d'une méta-analyse à effet fixe (les associations phénotypiques ont été évaluées séparément pour les panels de cas-témoins italiens et espagnols, en utilisant la régression logistique PLINK avec ajustement et stratification en fonction du sexe et de l'âge). Le seuil de signification statistique a été fixé à 5x10^-8.
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